Cómo hacer árboles filogenéticos

Cómo hacer árboles filogenéticos

Un árbol filogenético es una representación gráfica de las relaciones evolutivas que demuestra cómo los organismos podrían haberse apartado de un ancestro común. Anteriormente, esto se hacía mediante la comparación de la anatomía y la fisiología de los organismos vivos y los fósiles, pero ahora se usa comúnmente la información genética obtenida de las secuencias de nucleótidos de ADN. Se pueden encontrar organismos con pocas similitudes en las “ramas” separadas de un árbol filogenético y aquellos con puntos en común específicos se ubicarán en “ramitas” de la misma rama. Un árbol filogenético es un método para comprender las especies y los cambios evolutivos en los organismos.

    Seleccione un organismo modelo para la comparación de relaciones. Esto se puede hacer con una especie, raza o secuencia de nucleótidos que representa un organismo. Un organismo de ejemplo podría ser una vaca. el resto del árbol demostraría cuán estrechamente relacionado está una vaca con otros organismos basados ​​en rasgos genéticos.

    elegir un grupo externo un grupo externo es un organismo menos estrechamente relacionado o una secuencia de nucleótidos muy diferente. Si el organismo modelo es una vaca, entonces un posible grupo externo sería un pez. cuanto más diferentes sean dos organismos, más abajo en el árbol filogenético estará su punto de ramificación divergente. el tiempo se representa con la fecha más antigua en la parte inferior de la tabla y el día actual se encuentra en la parte superior de la tabla. la ubicación de las ramas muestra aproximadamente cuando en el pasado un rasgo evolutivo posiblemente cambió un organismo ancestral en diferentes especies.

    Determinar un conjunto de características a utilizar para la comparación. los ejemplos incluyen "tiene cuatro patas", "mastica cud", "da nacimiento vivo" o "crece el pelo". Las secuencias de nucleótidos son simplemente representaciones alfabéticas de ADN que determinan las características, por lo que otra opción sería: "contiene la secuencia atggacacgga".

    Dividir los organismos en función de las características. Cuando un organismo no contiene el rasgo deseado, se hace una rama en el árbol filogenético. porque el característico "tiene cuatro patas", las vacas, las ovejas y los ciervos estarían todos en una rama, mientras que los peces estarían en una rama separada. pegue la imagen o secuencia de una vaca en la esquina superior de la cartulina y el pez en la esquina opuesta y dibuje dos líneas desde la base del papel en forma de v en intersección.

    continúe separando los organismos modelo o las secuencias de nucleótidos hasta que cada ejemplo tenga una única separación de la rama en una ramita. la característica "tiene lana" separaría ovejas de ciervos y vacas en una rama singular. Coloque la imagen de la oveja cerca de la imagen del pez y dibuje una línea que se conecte en forma de v hasta la rama de la vaca. el uso de la característica "tiene cola esponjosa" demarcaría la vaca de los ciervos. pegue la imagen del venado entre la vaca y la oveja y dibuje otra línea en forma de v que se cruce sobre las líneas de pez y oveja. cuando cada especie tiene una sola rama, el árbol filogenético se ha completado.

    propina

    Elige un conjunto finito de organismos o secuencias. Elige características o secuencias que dividen los organismos en grupos separados. Tener múltiples apoyos característicos para demostrar relaciones con el organismo.

    advertencia

    La ubicación filogenética se puede debatir en función de muchas características y se requiere mucho apoyo para las opciones de ubicación. Las ecuaciones matemáticas pueden ser necesarias para demostrar la probabilidad estadística de cambios evolutivos. la probabilidad de divergencia en el nivel genético deja espacio para posibles inexactitudes en los árboles filogenéticos.



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