cuando un investigador de la escena del crimen o un médico obtienen una muestra de ADN, a menudo no hay suficiente ADN disponible para analizarla adecuadamente. Para simular el proceso de replicación de ADN propio del cuerpo, los científicos desarrollaron un proceso llamado PCR que puede actuar como una máquina xerox y hacer una copia después de una copia de una muestra de ADN. Hay muchos componentes de una reacción de pcr, y el cloruro de magnesio es uno de los más vitales.
imitando el cuerpo
la reacción en cadena de la polimerasa (pcr) se desarrolló para imitar la manera propia de la naturaleza de replicar el ADN. ADN es una secuencia repetitiva de nucleótidos, y cada nucleótido contiene tres partes. la columna vertebral del ADN es una unidad repetitiva de azúcar y fosfato, y cada azúcar tiene una base nitrogenada unida a ella. Hay cuatro bases nitrogenadas; guanina, citosina, adenina y timina. el ADN consiste en dos hebras de fosfato de azúcar paralelas entre sí con dos bases nitrogenadas que se unen entre cada dos azúcares. Cuando el ADN se replica en el cuerpo, una enzima llamada helicasa rompe los enlaces entre las bases nitrogenadas. una segunda enzima, la ADN polimerasa, une nuevos nucleótidos en lugar de los viejos. Finalmente, una tercera enzima llamada ADN ligasa se une a las nuevas moléculas nuevamente.
componentes de reacción pcr
se deben hacer algunos cambios para replicar el ADN en una reacción de laboratorio. En lugar de helicasa, una reacción pcr simplemente utiliza calor para romper los enlaces entre las bases nitrogenadas. La ADN polimerasa humana no es lo suficientemente estable como para soportar estas temperaturas. una molécula similar llamada taq polimerasa, o polimerasa termoestable, se usa en su lugar, porque puede soportar los requisitos de calor de pcr. Además, una reacción de pcr requiere nucleótidos libres, un tampón y magnesio.
El papel del cloruro de magnesio.
El cloruro de magnesio es el método preferido para agregar magnesio a un experimento de PCR. La polimerasa termoestable requiere la presencia de magnesio para actuar como cofactor durante el proceso de reacción. su papel es similar al de un catalizador: el magnesio no se consume realmente en la reacción, pero la reacción no puede continuar sin la presencia del magnesio.
efectos del abundante magnesio
Cuanto más magnesio se agregue a la reacción de pcr, más rápida será la reacción. Sin embargo, eso no es necesariamente algo bueno. Si hay demasiado magnesio presente, la polimerasa de ADN funcionará demasiado rápido y con frecuencia cometerá errores en el proceso de copia. esto conducirá a que se produzcan muchos filamentos diferentes de ADN que no necesariamente representan la muestra original que se proporcionó.
efectos del escaso magnesio
Si el magnesio tiene un suministro limitado en una reacción, no irá tan rápido como debería, en todo caso. puede intentar ejecutar un programa de 40 ciclos pero no obtener la cantidad de copias que desea. Cada ciclo de pcr duplica la cantidad de ADN en el tubo de ensayo de forma exponencial. así que mientras comienzas con una cantidad pequeña, terminas con muchas veces esa cantidad inicial al final. Si no hay suficiente magnesio, parte de la polimerasa de ADN no se activará y no funcionará. sin embargo, el calor habrá desarmado el ADN que ya está presente y no se volverá a unir. por lo tanto, todo el experimento se puede arruinar si no hay suficiente magnesio presente.